Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpv2Q9WTR1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv2Q9WTR1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms