Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syt6Q9R0N8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Syt6Q9R0N8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Syt6Q9R0N8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syt6Q9R0N8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syt6Q9R0N8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syt6Q9R0N8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syt6Q9R0N8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms