Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Bcl11aQ9QYE3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bcl11aQ9QYE3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms