Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWT9

Kifc1, Kinesin-like protein KIFC1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc1Q9QWT9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kifc1Q9QWT9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kifc1Q9QWT9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms