Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx20Q9JJY4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx20Q9JJY4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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