Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bgrlQ9JJU8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms