Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 306.9 ms