Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall1Q9ER74 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sall1Q9ER74 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms