Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SgshQ9EQ08 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SgshQ9EQ08 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms