Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tlr1Q9EPQ1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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