Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a1Q9EPE9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms