Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med29Q9DB91 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms