Protein–RNA interactions for Protein: Q9D711

Pir, Pirin, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PirQ9D711 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PirQ9D711 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PirQ9D711 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PirQ9D711 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PirQ9D711 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PirQ9D711 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PirQ9D711 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PirQ9D711 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PirQ9D711 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PirQ9D711 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PirQ9D711 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PirQ9D711 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms