Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3a3Q9D554 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sf3a3Q9D554 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms