Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp4Q9D4F8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms