Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prkrip1Q9CWV6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms