Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gadd45gip1Q9CR59 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms