Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc43Q9CR29 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms