Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim3Q99PE5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms