Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsnaxip1Q99P25 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsnaxip1Q99P25 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsnaxip1Q99P25 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsnaxip1Q99P25 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsnaxip1Q99P25 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsnaxip1Q99P25 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tsnaxip1Q99P25 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms