Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rwdd2bQ99M03 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rwdd2bQ99M03 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms