Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TirapQ99JY1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TirapQ99JY1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TirapQ99JY1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TirapQ99JY1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TirapQ99JY1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TirapQ99JY1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TirapQ99JY1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TirapQ99JY1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TirapQ99JY1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TirapQ99JY1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TirapQ99JY1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TirapQ99JY1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TirapQ99JY1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TirapQ99JY1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TirapQ99JY1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TirapQ99JY1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TirapQ99JY1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TirapQ99JY1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TirapQ99JY1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TirapQ99JY1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TirapQ99JY1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms