Protein–RNA interactions for Protein: Q99JF8

Psip1, PC4 and SFRS1-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psip1Q99JF8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psip1Q99JF8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psip1Q99JF8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psip1Q99JF8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psip1Q99JF8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psip1Q99JF8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psip1Q99JF8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psip1Q99JF8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psip1Q99JF8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psip1Q99JF8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psip1Q99JF8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psip1Q99JF8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms