Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y44

Brdt, Bromodomain testis-specific protein, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrdtQ91Y44 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BrdtQ91Y44 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BrdtQ91Y44 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BrdtQ91Y44 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BrdtQ91Y44 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BrdtQ91Y44 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BrdtQ91Y44 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BrdtQ91Y44 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BrdtQ91Y44 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BrdtQ91Y44 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BrdtQ91Y44 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BrdtQ91Y44 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BrdtQ91Y44 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BrdtQ91Y44 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BrdtQ91Y44 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BrdtQ91Y44 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BrdtQ91Y44 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BrdtQ91Y44 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BrdtQ91Y44 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BrdtQ91Y44 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BrdtQ91Y44 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BrdtQ91Y44 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BrdtQ91Y44 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BrdtQ91Y44 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms