Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chrna2Q91X60 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chrna2Q91X60 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chrna2Q91X60 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms