Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snx15Q91WE1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx15Q91WE1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Snx15Q91WE1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Snx15Q91WE1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx15Q91WE1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx15Q91WE1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx15Q91WE1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx15Q91WE1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx15Q91WE1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx15Q91WE1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx15Q91WE1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx15Q91WE1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx15Q91WE1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx15Q91WE1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx15Q91WE1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx15Q91WE1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx15Q91WE1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx15Q91WE1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx15Q91WE1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx15Q91WE1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms