Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ApobrQ8VBT6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ApobrQ8VBT6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms