Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm1Q8K377 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms