Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrit1Q8K099 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrit1Q8K099 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Lrit1Q8K099 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrit1Q8K099 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms