Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClasrpQ8CFC7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClasrpQ8CFC7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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