Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc28aQ8CEI3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc28aQ8CEI3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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