Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930507D05RikQ8C9C9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930507D05RikQ8C9C9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms