Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Ubqln3Q8C5U9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Ubqln3Q8C5U9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Ubqln3Q8C5U9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Ubqln3Q8C5U9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Ubqln3Q8C5U9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Ubqln3Q8C5U9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Ubqln3Q8C5U9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Ubqln3Q8C5U9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Ubqln3Q8C5U9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Ubqln3Q8C5U9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Ubqln3Q8C5U9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Ubqln3Q8C5U9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubqln3Q8C5U9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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