Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D4

Arhgap12, Rho GTPase-activating protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap12Q8C0D4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap12Q8C0D4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap12Q8C0D4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arhgap12Q8C0D4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap12Q8C0D4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap12Q8C0D4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap12Q8C0D4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap12Q8C0D4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap12Q8C0D4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap12Q8C0D4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap12Q8C0D4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap12Q8C0D4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap12Q8C0D4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms