Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd3Q8BHD4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Frmd3Q8BHD4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Frmd3Q8BHD4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd3Q8BHD4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms