Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms