Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrsam1Q80ZI6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrsam1Q80ZI6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms