Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otop3Q80UF9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Otop3Q80UF9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms