Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clec18aQ7TSQ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clec18aQ7TSQ1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.6 ms