Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snd1Q78PY7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Snd1Q78PY7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snd1Q78PY7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms