Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rapgefl1Q68EF8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rapgefl1Q68EF8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgefl1Q68EF8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms