Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2beQ64524 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2beQ64524 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hist2h2beQ64524 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2beQ64524 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2beQ64524 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2beQ64524 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2beQ64524 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2beQ64524 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2beQ64524 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2beQ64524 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2beQ64524 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2beQ64524 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms