Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim24Q64127 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim24Q64127 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim24Q64127 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms