Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfe3Q64092 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfe3Q64092 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfe3Q64092 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms