Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim21Q62191 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim21Q62191 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim21Q62191 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim21Q62191 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim21Q62191 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim21Q62191 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim21Q62191 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim21Q62191 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim21Q62191 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim21Q62191 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim21Q62191 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim21Q62191 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim21Q62191 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim21Q62191 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim21Q62191 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim21Q62191 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim21Q62191 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms