Protein–RNA interactions for Protein: Q61765

Krt31, Keratin, type I cuticular Ha1, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt31Q61765 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt31Q61765 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt31Q61765 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt31Q61765 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt31Q61765 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms