Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HnrnpdQ60668 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HnrnpdQ60668 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HnrnpdQ60668 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HnrnpdQ60668 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HnrnpdQ60668 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HnrnpdQ60668 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HnrnpdQ60668 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HnrnpdQ60668 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HnrnpdQ60668 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HnrnpdQ60668 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HnrnpdQ60668 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HnrnpdQ60668 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms