Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AbrQ5SSL4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AbrQ5SSL4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AbrQ5SSL4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AbrQ5SSL4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AbrQ5SSL4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AbrQ5SSL4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AbrQ5SSL4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AbrQ5SSL4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AbrQ5SSL4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AbrQ5SSL4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AbrQ5SSL4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
AbrQ5SSL4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AbrQ5SSL4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AbrQ5SSL4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AbrQ5SSL4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AbrQ5SSL4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AbrQ5SSL4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AbrQ5SSL4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AbrQ5SSL4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AbrQ5SSL4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms