Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo39Q5NBU5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms