Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Xirp2Q4U4S6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xirp2Q4U4S6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms